冷藏運輸集裝箱依靠電力驅(qū)動壓縮機(jī)，其電力由船上的發(fā)電機(jī)或者便攜式發(fā)電機(jī)提供。當(dāng)集裝箱到達(dá)碼頭之后，被轉(zhuǎn)運到底盤上，這些底盤一般都會裝有發(fā)電機(jī)組，即前文提到的發(fā)電機(jī)組。這樣，裝在底盤上的冷藏集裝箱就可以像拖車一樣，由拖頭牽引，在陸路繼續(xù)運輸。
冷藏運輸船的貨艙為冷藏艙，常隔成若干個艙室。每個艙室是一個獨立的封閉的裝貨空間。艙壁、艙門均為氣密,并覆蓋有泡沫塑料、鋁板聚合物等隔熱材料,使相鄰艙室互不導(dǎo)熱，以滿足不同貨貨物對溫度的不同要求。冷藏艙的上下層甲板之間或甲板和艙底之間的高度較其他貨船的小，以防貨物堆積過高而壓壞下層貨物。冷藏船上有制冷裝置，包括制冷機(jī)組和各種管路。制冷機(jī)組一般由制冷壓縮機(jī)、驅(qū)動電動機(jī)和冷凝器組成。
盡管成本高溫控效果也不盡如人意，運輸公司還是選擇航空冷藏運輸作為一種快速的運輸手段，通常用來運輸附加值較高，需要長距離運輸或者出口的易腐貨品，例如鮮切花及某些熱帶水果等。當(dāng)采用空運時，為了適合飛機(jī)某些位置的特殊形狀，需要將貨品裝入集裝器(ULD，也稱為航空集裝箱)。一般的冷藏集裝器采用干冰作為冷媒，但是干冰作為冷媒具有一定的局限性：控溫精度不高；沒有加熱功能；需要特殊的加冰基站等。近來Envirotainer公司推出的新型RKNe1系列航空溫控集裝箱解決了上述困擾，它采用機(jī)械壓縮式制冷方式，使用英格索蘭公司冷王(ThermoKing)品牌的AIR100制冷機(jī)組，如下圖。該航空溫控集裝器主要應(yīng)用于一些特殊的溫控運輸用途，例如疫苗以及對溫度敏感的藥品(蛋白質(zhì)類藥物)等，其溫度控制范圍一般在2℃至8℃，或者室溫2℃至8℃，這些貨品都具有很高的附加值
